L'invention concerne un procédé servant à dissoudre des acides nucléiques chargés dans un premier liquide organique non miscible avec l'eau. Le procédé selon l'invention comprend les étapes suivantes : a) mise à disposition d'une solution des acides nucléiques dans un deuxième liquide aqueux; b) précipitation des acides nucléiques par ajout dans le deuxième liquide d'un agent complexant formant avec les acides nucléiques des complexes non solubles dans le deuxième liquide; c) séparation des complexes du deuxième liquide; d) dissolution des complexes dans un troisième liquide constitué d'un composé amphiphile ou contenant un composé amphiphile; e) mélange du troisième liquide avec le premier liquide.