La présente invention concerne des systèmes microfluidiques utilisant des plates-formes à disque microfluidique rotatif comprenant des structures à microcanal. Plus spécifiquement, la présente invention concerne un procédé et une configuration permettant de commander les particules magnétiques dans les structures à microcanal d'un dispositif microfluidique. L'invention repose sur le contre-balancement de la force magnétique et la force centrifuge exercées sur les bourrelets lors de la rotation des structures à microcanal à différentes vitesses près d'un réseau d'aimants.