La présente invention concerne un procédé pour la prédiction en ligne de la performance future d'une unité de fermentation, notamment des paramètres tels que la concentration de produit, de biomasse, de sucre dans le bouillon de l'unité de fermentation discontinue/à alimentation discontinue contenant des bactéries et des nutriants. Un modèle informatique prédit la concentration de produit futur en fonction des données actuelles de l'installation. Lors du déroulement de la fermentation discontinue, les paramètres du modèle sont ajustés en ligne en fonction des données de l'installation afin de réduire le décalage entre l'installation et le modèle. Le procédé/modèle de fermenteur est mis en oeuvre sous la forme d'un programme dans un ordinateur personnel qui peut être en interface avec des systèmes de commande de l'installation pour le déploiement en ligne dans un environnement d'installation réel. Un système de surveillance en ligne de performance est utile au personnel exploitant l'installation leur permettant de connaître la performance de la fermentation discontinue préalablement à la prise de mesures correctives à l'avance pour l'amélioration/le maintien de la performance au niveau souhaité.