Les maladies infectieuses chez les animaux d'élevage constituent un des facteurs économiques les plus importants dans l'industrie avicole. L'une des principales maladies chez les oiseaux est due à une infection provoquée par le virus de l'entérite hémorragique (HEV) qui supprime les réactions immunitaires. La présente invention concerne des molécules d'acide nucléique codant des protéines structurales du virus de l'entérite hémorragique (HEV) pouvant déclencher une réponse immunitaire vis-à-vis du HEV chez un animal, en particulier chez des oiseaux. En particulier, l'invention concerne des séquences d'acide nucléique qui codent la base hexonique, la base pentonique ou les protéines fibreuses du HEV. Les peptides codés par les molécules d'acide nucléique de l'invention et tout vecteur ou ADN de synthèse les comprenant font également l'objet de cette invention. Un vaccin peut comprendre comme principes actifs une molécule d'acide nucléique selon l'invention, une protéine codée par cette molécule, un ADN de synthèse comprenant ladite molécule d'acide nucléique, ou tout mélange de ceux-ci.