L'invention concerne un procédé de remplissage avec des produits (1) d'alvéoles (2) situés dans un film (3) au moyen d'une machine à thermoformage, ces alvéoles n'étant pas remplis correctement au niveau de la station de remplissage de la machine à thermoformage. Après le processus de remplissage dans la station de remplissage, l'état de remplissage de chaque alvéole est contrôlé et un alvéole (2') non correctement rempli est signalé. Dans une unité (7) de poursuite de remplissage, une tête de remplissage (8) est remplie avec des produits (7). L'information concernant le positionnement sur le film de l'alvéole non correctement rempli, signalé est saisie et transmise à l'unité de poursuite de remplissage. La tête de remplissage (8) située au niveau d'un bras (9) pouvant être déplacé dans un plan parallèle au film (3) est positionnée au dessus de l'alvéole signalé (2') et remplit avec le produit (1) directement cet alvéole (2').